Genvarianten finns inte i Afrika, varifrån Homo sapiens migrerade för cirka 60 000 år sedan, eller hos neandertalarna, som våra förfäder parade sig med i Europa.
Forskarnas teori är därför att vi fick det genetiska avtrycket genom att para oss med Denisova-människor, som också bär på genvarianten.
Försök på mänskliga njurceller har visat att genen påverkar mängden zink i cellerna – vilket bl.a. ökar motståndskraften mot kyla.
"Uppenbarligen var förändringen gynnsam och visade sig vara en selektiv fördel för människan", säger Jorge Garcia-Calleja, en av forskarna bakom analysen.
Genen gjorde oss köldhärdiga
Denisovanernas genetiska arv kan ha hjälpt våra förfäder att klara sig bättre i de kalla regionerna i Europa, men samma genvariant "är också känd för att vara förknippad med större känslighet för flera neuropsykiatriska störningar", skriver forskarna.
Därför är det troligt att priset för våra förfäders förhistoriska sex med denisovaner kom i form av ett mer bräckligt psyke.
De spanska forskarna nämner själva depression, schizofreni och anorexi som sjukdomar som vi kan ha ärvt från våra nu utdöda släktingar.